成年后，西班牙的伊莎贝拉二世积极参与政府运作，但是在其统治期间却异常不受欢迎。人们认为她只亲近周围的人，而毫不关心西班牙的普通民众。1856年，她试图建立一个置于莱昂帕多·奥唐奈尔领导之下的跨国联盟——伊比利亚联盟，此时后者已经进军至马德里并解散由埃斯帕特罗组织的一届政府。但是伊莎贝拉的计划最终宣告失败，她的政治威信以及在民众中的受欢迎程度都大受打击。
1860年，伊莎贝拉发动一场由奥唐奈尔和胡安·普里姆指挥的、针对摩洛哥的战争，并取得胜利。这场战争提升伊莎贝拉在国内的威望。但是，钦查群岛战争期间的一场企图重新夺回秘鲁和智利的战役中，西班牙被南美国家所击败，遭遇到灾难性的失败。
1866年，胡安·普里姆领导的一次叛乱被镇压。但是很清楚，西班牙人民对伊莎贝拉的统治日渐不满。1868年，爆发光荣革命，进步人士弗朗西斯科·塞拉诺和胡安·普里姆联手发动叛乱，并在阿尔科莱阿战役中击败伊莎贝拉的军队。伊莎贝拉被放逐至巴黎。
之后两年西班牙又爆发革命，陷入无政府状态。1870年，西班牙议会宣布西班牙将会拥有一位新的国王。事后证明，这个决定在欧洲历史乃至世界历史中都扮演重要角色——由于法国反对德意志霍亨索伦王室的利奥波德亲王为王位候选人而发动普法战争。最后，议会选举意大利萨伏依王朝王子阿马德奥亲王为新王，并于1871年加冕。1869年宪法使得阿马德奥一世成为西班牙国王，西班牙诸国到西班牙的转变，象征这个国家进一步的统一。
阿马德奥作为自由党人，已经向自由主义宪法宣誓。但是他立即就面临着一个艰巨的任务——整合四分五裂的西班牙政治形态。他为西班牙人之间以及西班牙各政党之间的相互斗争所折磨。
第一共和国时期
在伊达尔戈事件（Hidalgo affair）之后，阿马德奥公开宣称西班牙人民是不可治理的，并逊位离开这个国家。王位虚悬时期，由激进派和共和党人组成的政府宣布成立西班牙共和国。
共和国马上就面临着危机四伏的局面——卡洛斯派是其中最直接的威胁，他们在1872年选举中的惨淡表现之后发动一次大规模的暴动；而第一国际亦号召发动社会主义革命；起义和动荡局面席卷纳瓦拉和加泰罗尼亚地区；此外共和国亦为罗马天主教会所反对。
复辟时代
虽然前女王伊莎贝拉二世仍然在世，但是她已经意识到自己可能会再次引起国内的分裂，于是在1870年她放弃王位转而支持她的儿子阿方索，后者正式加冕为西班牙的阿方索十二世。在西班牙第一共和国的骚乱局面之后，西班牙人更乐于接受波旁王朝统治下的秩序的回归。当时正在国内抵抗卡洛斯派暴动的共和军在马丁内兹·坎波斯准将的带领下于1874-1875年冬季向阿方索效忠。共和派政府被解散，随后在1874年新年前夕，阿方索任命他所信任的顾问安东尼奥·卡诺瓦斯·德尔·卡斯蒂洛为首相。阿方索主动出击，有力的镇压卡洛斯派，并很快的赢得大部分西班牙国民的支持。
西班牙很快就恢复秩序，帕拉希德斯·门托·萨迦斯塔所领导的自由派和安东尼奥·卡诺瓦斯·德尔·卡斯蒂洛所领导的保守派轮流执掌政权。在阿方索十二世统治期间，西班牙的政局得到改善，经济也获得部分的恢复。1885年，阿方索去世；之后卡诺瓦斯·德尔·卡斯蒂洛又于1897年被刺杀，政局再次动荡不安。
1868年开始的十年战争中古巴开始反抗西班牙的殖民统治，这导致西班牙的新世界殖民地上废奴主义盛行。美国对该岛和岛上的人民很感兴趣，遂使得局势愈加恶化。美国缅因号战舰的爆炸引发1898年的美西战争，西班牙遭遇到灾难性的失败。最终古巴获得独立，而西班牙则失去它在新世界的最后一块殖民地——它将波多黎各连同太平洋上的关岛和菲律宾以20万美元割让给美国。1899年，西班牙将其在太平洋上仅剩的几个岛屿——北马里亚纳群岛、加罗林群岛和帕劳卖给德国，至此，西班牙的殖民地只剩下非洲的西属摩洛哥、西属撒哈拉和西属几内亚。
灾难的1898年
灾难性的1898年催生98世代，这批人由要求新政府变革的政治家和知识分子组成。无政府主义运动和法西斯主义运动在二十世纪初的西班牙盛行。1909年，加泰罗尼亚地区的一场叛乱被残酷镇压。
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