约定之日，神秘组织大军来袭，却发现各大门派严阵以待。一时间，刀光剑影，喊杀震天。林羽、苏瑶穿梭战场，救助伤者、反击敌寇。激战中，林羽窥见组织头目藏身暗处指挥，施展轻功“凌云步”直逼而去。头目大惊，祭出法宝“九幽噬魂幡”，幡影舞动，鬼哭狼嚎，蛊惑人心。苏瑶及时赶到，奏响“清心瑶琴曲”，琴音如水，抵消幡影魔力。
林羽趁机近身，以内力震碎“九幽噬魂幡”，头目慌乱逃窜，却被各派高手围堵。大势已去，神秘组织兵败如山倒。此役后，江湖重归平静，各大门派感恩林羽、苏瑶预警守护，设宴款待。宴会上，林羽举杯：“江湖安宁非一人之功，望往后大家携手，共护江湖正义。”苏瑶浅笑附和，杯盏交错间，新的江湖佳话流传开来，可二人明白，江湖风波无尽，未来仍需枕戈待旦，守护这片热血江湖。
随着江湖渐趋安稳，林羽与苏瑶决定暂别江湖纷扰，回山闭关修炼，钻研医武融合之术，期望突破自身瓶颈。山中岁月悠悠，春去秋来，花开花落，二人武艺、医术皆大有精进。一日清晨，山林间灵雾氤氲，鸟鸣婉转，林羽于溪边练剑，剑气如虹，引得溪水激荡；苏瑶在山洞调配新药，药香四溢，弥漫山谷。
就在此时，一阵急促敲门声打破宁静。开门一看，竟是位稚气未脱小沙弥，手持书信，气喘吁吁：“神医侠侣，少林寺遭遇重创，方丈身负重伤，求二位速去救治！”林羽接过书信，只见信上字迹潦草，透着慌乱，详述少林遭神秘黑衣团伙突袭，寺内秘籍失窃，诸多武僧受伤。“定是江湖余孽作祟，苏瑶，咱们即刻启程。”林羽神色凝重。
二人日夜兼程赶到少林，只见古刹庄严不再，山门破损，庭院血迹斑斑。入内堂，少林方丈面色惨白、气息微弱，周围僧众满脸悲戚。林羽上前把脉，皱眉道：“方丈所中是极为罕见的‘蚀骨绵掌’，掌力侵入脏腑，持续侵蚀，甚是棘手。”苏瑶取出银针：“先以银针封住部分经脉，延缓掌力蔓延。”
施针完毕，林羽又调配解毒祛瘀药膏，亲自为方丈敷上。待方丈稍有起色，询问之下，得知突袭之人个个武功高强，黑衣遮面，招式诡异，临走还留下狠话：“武林秘籍归我，不服者灭门。”林羽心头火起：“嚣张至极，绝不能放过他们。”
循着线索追踪，二人来到一处隐秘山谷。谷中阴森，迷雾重重，隐约可见几座茅屋。靠近时，林羽察觉四周布有奇门遁甲之阵，稍有不慎便会陷入迷障。苏瑶祭出罗盘，依五行方位破解阵法，悄然潜入。屋内，黑衣团伙正围坐商议，桌上堆满失窃秘籍。林羽怒喝：“作恶多端，今日便是你们受罚之时！”
众人受惊跳起，纷纷拔刀。一场恶战拉开帷幕，黑衣人头领使出“幻影刀法”，刀影层层叠叠，如恶鬼扑食；林羽施展新悟“乾坤太极剑”，剑身环绕太极图纹，四两拨千斤，化解刀势。苏瑶在旁以“蝶舞绫罗鞭”辅助，鞭梢闪烁寒光，抽向敌人要害。激战中，林羽瞅准头领换气瞬间，以剑尖挑飞其面罩，竟是昔日叛出师门的败类“狂刀浪子”。
“狂刀浪子”见身份败露，愈发疯狂，祭出绝招“灭世狂刀斩”，刀风呼啸，劈开巨石。林羽、苏瑶联手应对，双掌、长鞭齐出，抵住刀劲。关键时刻，苏瑶甩出“定魂银针”，射中“狂刀浪子”手臂，刀势一偏。林羽顺势全力一击，“乾坤太极剑”贯穿其胸口，“狂刀浪子”倒地身亡，其余喽啰四散而逃。
夺回秘籍，归还少林，寺中僧众感恩戴德，诵经祈福为二人祝愿。经此一役，林羽与苏瑶深感江湖虽历多次整顿，隐患仍存。二人商议后，决定开宗立派，广收门徒，将医武之道传授下去，期望培养一批心怀正义、济世救人的江湖新秀，护这江湖长治久安。
开山收徒当日，各地豪杰、百姓慕名而来，望着台下诸多热忱脸庞，林羽与苏瑶相视一笑，携手开启江湖传承新篇章。往后岁月，门派中弟子研习武艺、医术，时常出山行侠仗义，神医侠侣之名不仅是二人专属，更化作门派精神代代流传，江湖因他们持续焕发生机，故事在热血传承中绵延不绝，直至岁月长河尽头，传奇熠熠生辉。
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