另外由于战争，北京城里的秩序发生了短暂的混乱，造成了5座教堂受到冲击，2座教堂， 20余座住宅被烧毁，300余居民死亡，因此在人民军完全控制了北京城之后，立刻就着手对北京的秩序进行了整顿，当街击毙57人，其中零散的八国联军士兵15人；抓捕113人，零散的八国联军士兵22人，终于成功的震摄住了北京城里企图趁乱闹事、混水摸鱼的人。
而在最后，诸亚平还向秦铮报告了李壮勇违抗军纪，杀死投降士兵，造成7名人民军战士牺牲的事件，一团的团部己对李壮勇的处罚做出了决定，撤消李壮勇的班长职务，降为普通士兵，记大过一次，并做深刻检讨，另外李壮勇所在的排、连均做检讨。
本来李壮勇的违纪事件没必要向秦铮报告，不过李壮勇是一营的士兵，而一营的营长罗岳和秦铮的关系也不是秘密，虽然这一次的处罚并没有牵连到罗岳，只到连一级就为止了，但还是说一下为好。
秦铮听完以后也沒有说什么，毕竟李壮勇的违纪事件后果太严重了，造成7名战士的死亡，直接将他枪毙都不为过，因此对他做出的处罚也绝对不过份，而且并没有牵连到罗岳，其实罗岳现在己是营长，手下管着好几百号人，不可能为一名普通班长的过失负责。
听完了战果的汇报之后，秦铮首先对一团、二团、五团的表现进行了表扬，毕竟这是一个大胜仗，然后决定对目前的军队人员安排布置进行一次分派，因为现在北京城里已经集中了5个团，总兵力约在1万2千人左右，再加上随行的行政管理人员，总计可以达到1.3万余人，这么多人员自然不能全部住在皇宫里，到不是说皇宫住不下，而是所有人员都住在皇宫里，也有诸多的不便，何况皇宫里还有不少珍宝和大量的宫女，人民军成立的时间毕竟不长，面对这些诱惑，难免会有人把持不住。而且将军队、人员分布出去，也有利于对北京城的控制。
当然，人民军也不会全部撤离皇宫，人民军侑总拈挥部就设在皇宫里，这样可以表示穿越者对清廷皇权的蔑视，可以淡化人民军的本土士兵对皇权的敬畏心理，另外也是向清廷施加压力，穿越者对在上海谈判期间，清廷打算单独和各国签定割地赔款的条约相当的不满意，因此也借这个机会向清廷示威，毕竟在这个时代，皇权依然有巨大的威摄力，而做为皇权的俱体像征，皇宫也同样有非凡的意义。
而人民军占据皇宫，并在皇宫里设立指挥部，如果清廷得知，肯定会感到恐惧，因为穿越者不同于八国联军，他们是以华夏后裔自居，因此清廷也就会自然而然的想到，海外华人是否会打算在北京建朝立国，豋基座殿呢？这样就可以迫使清廷接受穿越者的条件。
秦铮决定，将皇宫分为两个部份，以保和殿为界，前部份为人民军的指挥部，包括皇宫的三大殿，其中太和殿做为指挥中心，而以中和殿为会议室，秦铮的办公地点设在太和殿左边的弘义阁，同时也是军部办公区；而民政办公区则设在右边体仁阁。其余地方均做为宿舍，并由一团驻守皇宫。
保和殿以后的部份，则交给皇宫里的太监宫女管理，人民军只是定期派遣部队进驻巡逻、值守，而且没有军部的命令，任何人不得随意进入。
二团和五团则分别驻守天坛和先坛，这两个地方均位于北京外城。六团则负责驻守北京的十三个对外的城门，每个城门设两个排；而九团则驻守三个内城门，以及协助民政部维持北京城里的秩序。而穿越者的管理人员都居住在午门外的社稷坛和太庙，本土的管理人员则住在皇宫外东南角的六部衙门。
同时秦铮又授权李松晨，马上成立北京临时管理委员会，负责管理北京城的各项事务。
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