呼应三好军的入江春景于高槻城遭织田信长进攻，入江春景投降后，织田信长不再原谅其背叛而处刑之。同一天，织田信长要求堺市交出两万贯的矢钱（军费），要求商人们服从织田家。此动作让堺会合众（商人联合会）原先仰赖三好三人众抵抗织田信长，在三好三人众为织田军击退后，臣服于织田信长。如此一来，织田信长成功地扩大于畿内的势力。同年，织田信长为限制足利义昭的幕府将军权力，订立了称为“殿中御掟”9条的掟书（公布法或公定法）之后又追加了7条昭告天下，并让足利义昭承认这项命令。但因此事使得足利义昭与织田信长的对立已然成形。
永禄十三年（1570年）4月，织田信长为了讨伐数度无视上洛命令的越前大名朝仓义景，打破了与浅井长政同盟时的约定（不得进攻浅井氏的盟友朝仓氏），并与盟友德川家康一起进军越前。信长此时已经开始展露自己今后的行事风格，即我行我素且不受束缚。织田、德川联军逐步攻击朝仓氏各个城池，进逼到金崎城时，浅井长政突出兵救援朝仓氏，织田信长察觉浅井长政叛变后，开始进行撤退，导致联军陷入退路被截的危机。织田信长在负责断后的殿军池田恒兴（殿军总大将）、明智光秀、木下秀吉（即日后的丰臣秀吉）等人的奋战之下（此即金崎之战），终于得以逃回京都。织田信长返回京都时，据言身边只剩下约10人。将军足利义昭趁此机会与织田信长的对立白热化，发布了打倒织田信长的命令到各国，包括朝仓义景、浅井长政、武田信玄、毛利辉元、三好三人众，甚至比睿山延历寺、石山本愿寺、杂贺众等寺庙势力都被找来，组成了“信长包围网”（のぶながほういもう）。为对抗包围网，织田信长开始讨伐浅井长政。
永禄十三年（1570年）6月，在近江姊川河原联合德川家康军与浅井、朝仓联军对战（姊川之战）。会战中织田军一度因浅井方先锋矶野员昌突破了自军13段备的11段而陷入苦战，幸有赖德川军击破朝仓军后联手夹击浅井军，终于击溃浅井、朝仓联军，信长因此对德川军的戒备和防范心理开始有了放松的迹象，但并不明显。
元龟元年（1570年）8月，织田信长出兵讨伐于摄津举兵的三好三人众，因石山本愿寺的援军等原因而苦战。织田信长本队在摄津国与三好三人众对阵时，浅井长政、朝仓义景、延历寺等3万联军进攻近江坂本，抵抗联军攻势的近江织田军败于人数上的劣势，信长重臣中名将森可成与织田信长之弟织田信治因此战死。为此织田信长于9月23日凌晨神速从摄津本队返回近江，慌乱的浅井长政、朝仓义景等人于比睿山布阵抵抗织田信长。织田信长则在近江国志贺与浅井、朝仓联军对峙（志贺之阵）。然而此时受命于本愿寺法主显如的伊势长岛一向一揆众举起叛旗，织田信长之弟织田信兴、重臣坂井政尚因此丧命，织田信长也陷入进退不得的窘境。为打开窘境，织田信长奏请正亲町天皇颁布敕令。12月13日，因天皇敕令而成功与浅井、朝仓军和解。此时据大久保忠教所记载的“三河物语”中，提到织田信长对朝仓义景的说法是“天下是朝仓大人所有，我将不再妄想”。元龟二年（1571年）9月，织田信长数度要求僧兵撤退，发出多次“避难劝告”，后放火烧掉仍持续抵抗的比睿山延历寺，即火烧比睿山（ひえいざん），此举坚定了武田信玄（たけだしんげん）上洛的决心。成为佛敌后的织田信长，一向一揆以及浅井、朝仓方面再度出兵。
元龟三年（1572年）7月，织田信长嫡男织田信忠初次出阵。此时织田军和浅井、朝仓联军之间有持续不断的小规模战斗，但战况渐渐对织田信长一方有利。8月，朝仓军的武将前波吉继、富田长繁、户田与次等人投降织田信长。10月，甲斐的武田信玄呼应足利义昭的出兵邀请，终于开始上洛。武田军总兵力3万，大军开始侵攻织田领地的东美浓与德川领地的远江、三河。织田、德川军开始抵抗。但在武田军武将秋山信友进攻东美浓的岩村城时，城主的远山景任（直廉）病死。景任遗孀岩村殿（信长的叔母）将织田信长五男坊丸（日后的织田胜长）收为养子，并立织田胜长为城主抵抗来军，秋山信友对岩村殿使出结婚的谈和条件。实际上岩村殿的女儿雪姫和武田胜赖结婚生下武田信胜，岩村殿跟武田氏也可说有姻亲关系。因此，岩村殿开城投降并和秋山信友结婚，把坊丸做为人质送往甲斐，令东美浓大半落入武田的支配。同年，武田军大举出征，目标是德川军三河的领地，德川军于一言坂之战为武田军大败，接着连远江、三河诸城都一一陷落，战况逐渐对德川军不利。信长为挽救战况，派出由佐久间信盛、平手泛秀领兵的3000名援军到三河，但在12月远江三方原之战（みかたがはらのたたかい）中，织田、德川联军被武田军大败，平手泛秀战死，结果援军未能解救德川军，退回岐阜。
元龟四年（1573年），武田军继续西上，从远江开始进攻三河。2月，开始攻击三河的野田城，而将军足利义昭则在三好义继及松永久秀等人协助下举兵呼应武田信玄的上洛行动。两面受敌的织田信长为解决困境，4月5日，经正亲町天皇出面（发出敕令）与足利义昭和解。接着4月12日，正当武田信玄一举上洛之时突然病死于信浓国驹场（今长野县下伊那郡阿智村），武田军带回信玄遗体返回甲斐。
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