在盟军摧毁了尤里在维尔京群岛部署威胁天气控制机原型机的战术核弹发射井后，一些幸存的美军决定发出S.O.S.信号并揭示自己的位置。重组至悖论远征军的太平洋阵线派出了由长间晋三与白田直美进行救援任务。
（三十年之后应该叫白田真丑才对，不过是三十年前直美大妈应该是不到三十的小姐姐，就想程世涛武秀荣戴宏奎一样，反推三十年还很年轻的，不过命令与征服里最强将军凌将军反推三十年凌梁就只能十岁出头了）
（额外吐槽，凌梁十几岁就是是最强指挥官过于离谱，拥有命令与征服全球科技并且站在世界顶点凌梁指挥能力异常强大，如此年轻又如此强大这些设定当然不合理，其实是制作组没钱赶工，取消了美国的艾恩赛德将军和GLA的莫马尔“死亡袭击”Boss将军的地位，时间有限做不出来了，就一股脑把他们的能力和科技全塞给了CN的凌梁了导致了命令与征服世界观的凌梁的指挥能力过于逆天）
在维尔京群岛的太平洋阵线部队解除了当地厄普西隆军的威胁之后，他们与其他从亚洲和大洋洲地区逃离出来的盟友重新联合，并一同加入到了悖论远征军中。而不久之后，他们便收到了一个由美军部队发出的求救信号：
这些美军现在位于美国海外领地波多黎各的首府圣胡安。早在第三次世界大战中，波多黎各就被拉丁同盟的部队攻占了，而在厄普西隆崛起后，心灵军团在尤里的精心计划之下，不费吹灰之力就控制了当地的拉丁同盟部队并借此彻底占领了波多黎各。
现在，这些在圣胡安聚集的美军幸存者已是陷入绝境之中。如果放任不管的话， 他们要么会被精与阴谋的尤里用心灵控制变成傀儡，要么会被心灵军团控制的傀儡拉丁同盟的部队消灭。悖论远征军中，美军部队的规模并不是很大，而美国本土的反抗军在一次失败的行动之后也鲜有条件离开本土加入悖论远征军的行列。为了扩充盟军自身的实力，团结一切力量，两位太平洋阵线的指挥官长间晋三与白天直美决定去营救他们。
圣胡安市有一座桥，这是当地美军撤离的唯一途径。根据侦察，盟军还在这座城市中发现了一座包围的基地，碉堡将军在此地固守。两位指挥官决定先派遣两支突击队渗透入市区内联系碉堡将军的基地，然后借此联系大部队进行支援，一同协助美军幸存者安全撤退。
长间晋三：“我们先用少数海豹部队和反转士进行渗透作战，基地车和大部队已经准备好伞降或者超时空传送，你说美国反抗军能坚持到和我们接头吗？”
白田直美：“我不知道，但是现在率领美国反抗军坚守阵地的是碉堡将军，我一生沉浸海战，若有人和我进行海战博弈，我不惧怕任何人！如果要你长间晋三赌上你一生的荣耀进行进行武士对决，你会惧怕吗？”
长间晋三挑起眉头：“吾意志尖锐如刀，是我低估了同为武士的碉堡将军意志，我再此为我的行为致歉！”
白田直美：“碉堡将军作为武士已经孤军深入，现在该我们了！”
反转士和海豹部队在城市内的河岸里面潜水渗透，整座名为圣胡安的城市已经变成了尤里手下行尸走肉的拉丁同盟大本营，被心控的拉丁同盟士兵正在押运一群镇暴部队前往战俘营，想必是想将这些美国反抗军洗脑成尤里的傀儡部队。
没人会注意水下的潜泳部队，但是忠实的防御建筑可会，哨戒机枪发现了没有友军识别的异常目标，立刻开始了对反转士的攻击。
反转立场作用在了哨戒机枪之上，因果已经被反转，这些哨戒机枪不再能伤害敌人，海豹部队开始了安放炸药，设定好起爆时间，在跳回水里。
渗透部队小心翼翼的在城市中行动，在尤里的心控能力之下，巡逻部队只是象征性的巡逻，大多数心控部队都驻扎在房屋之内。全部的心灵都已臣服于心灵信标。是时候解放自由意志了！
看来有必要解救之前被逮捕的镇暴部队了，让这些驻守在房屋内部的傀儡部队和邪恶的厄普西隆军死在闪光破片手雷之下了！
辐射工兵，捷豹战斗坦克，和磁暴线圈看守着镇暴部队，这显然不是镇暴部队可以对抗的威胁，反转士们悄悄渗透，随后投掷反转立场，海报部队立刻用手中的冲锋枪和C4炸弹收割这些处于反转立场的敌人。
这些傀儡部队武器不生效依然毫不在乎自己的生死的开火，就算队友死亡也无动于衷，直到全被特种部队完全消灭为止。
镇暴部队：“让我们离开这个充满洗脑的鬼地方！自由意志荣光永存！”
海报部队：“这就是邪恶尤里要建立的帝国吗?全都是没有思想的人偶，这样的社会还有什么意义可言！”
反转士：“我们要自由！还有牛排！还有自由！绝不沦为没有思想的奴隶！”
大量被心控的傀儡部队驻扎在平民建筑内，他们再也不会醒来了，因为镇暴部队的破片闪光手雷被扔进了这些建筑之内，他们永远都睡在了这座洗脑之城内。
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